Дата принятия: Герб утверждён решением Совета депутатов Шебекинского района и города Шебекино №8 от 26.01.2003 г.
Автор: Пальваль В. М., Пальваль С. В., Шаповалов В. А.
В червлёном поле золотая бревенчатая башня с закрытыми воротами, чёрными бойницами, золотыми шатровой кровлей и крытой шатром смотровой площадкой и прапором наверху, сопровождаемая по сторонам двумя серебряными подковами; в вольной части щита — герб Белгородской области.
Золотая бревенчатая башня с закрытыми воротами, чёрными бойницами, золотыми шатровой кровлей и крытой шатром смотровой площадкой и прапором наверху на гербовом щите символизируют ратные подвиги русских воинов по защите южных рубежей Русского государства со времен сторожевой и оборонительной службы на Нежегольском участке Белгородской защитной Черты в XVII веке до сражений на землях современного Муниципального района «Шебекинский район и город Шебекино» в период Великой Отечественной войны 1941—1945 годов. Две серебряные подковы по сторонам башни символизируют развитые в последние века на территории района земледелие и промышленность[2].
Расположенный в вольной части герб Белгородской области, утверждённый 15 февраля 1996 года, воссоздан на основе герба Белгородской губернии 1730 года.